Zobacz też: Schemat rozgrywek
Puchar Polski będzie rozgrywany w systemie "przegrywający odpada", w formie pojedynczych meczów w każdej rundzie. Pary wyłaniane są w losowaniu. Do IV rundy włącznie przy rozstawieniu do losowania zastosowane zostanie kryterium geograficzne. Gospodarzem każdego meczu jest drużyna z niższej ligi lub wyłaniany jest on w losowaniu.
Dla czterech najlepszych drużyn zorganizowany zostanie turniej finałowy w formule Final Four. Organizator turnieju zostanie wyłoniony przez Komisję Przyznawania Turniejów Szczebla Centralnego po wyłonieniu czwórki uczestników.
Trzy najlepsze drużyny Pucharu otrzymają prawo gry w rozgrywkach centralnych Intermarché Basket Cup, organizowanych przez Polską Ligę Koszykówki SA.
Terminarz rozgrywek, zgłoszeń i losowań:
Zgłoszenia drużyn spoza 1 Ligi Mężczyzn i 2 Ligi Mężczyzn – do 30 września 2013 r. (poniedziałek)
Losowanie I rundy – 1 października 2013 r. (wtorek)
I runda – 23 października 2013 r. (środa)
Losowanie II rundy – 24 października 2013 r. (czwartek)
II runda – 6 listopada 2013 r. (środa)
Losowanie III rundy – 7 listopada 2013 r. (czwartek)
III runda – 20 listopada 2013 r. (środa)
Losowanie IV rundy – 21 listopada 2013 r. (czwartek)
IV runda – 4 grudnia 2013 r. (środa)
Przyznanie organizacji turnieju Final Four – najpóźniej 12 grudnia 2013 roku (czwartek)
Final Four PZKosz – 28-29 grudnia 2013 r.
3 najlepsze zespoły awansują do fazy centralnej z udziałem zespołów z Tauron Basket Ligi.
Terminy fazy centralnej prowadzonej przez PLK SA:
Losowanie I rundy centralnej – 3 stycznia 2014 r. (piątek)
I runda – 15 stycznia 2014 r. (środa)
Losowanie II rundy – 16 stycznia 2014 r. (czwartek)
II runda – 5 lutego 2014 r. (środa)
Final Four: 8-9 lutego 2013 r. (sobota–niedziela)
