Puchar jest rozgrywany w systemie "przegrywający odpada", w formie pojedynczych meczów w każdej rundzie. Pary wyłaniane są w losowaniu. Do IV rundy włącznie przy rozstawieniu do losowania zastosowane zostanie kryterium geograficzne. Gospodarzem każdego meczu jest drużyna z niższej ligi
lub wyłaniany jest on w losowaniu. Dla czterech najlepszych drużyn zorganizowany zosta nie turniej finałowy w formule Final Four.
Zgodnie z przewidywaniami niepokonane w grupie A MKK Siedlce głównie za sprawą lepszej skuteczności z dystansu okazał się lepszy od ŁKS SMS Łódź, wygrywając 57:41. W kolejnej rundzie znalazł się też inny zespół z "grupy północnej" AZS Uniwersytet Gdański. Ekipa z Trójmiasta w lidze nie wygrała jeszcze meczu, ale w Olsztynie była lepsza od grającego w odmłodzonym składzie KKS-u. Mimo 27 strat UKS Basket Aleksandrów Łódzki pokonał w Sosnowcu miejscowyJAS-FBG, głównie znacznej przewadze pod tablicami. Miejscowe przegrały spotkanie 61:71, ale zebrały aż o 19 piłek mniej. Jedynym zespołem, który wykorzystał atut własnego parkietu była Ślęza Wrocław, lepsza od grającego w niepełnym składzie Poznań City Center AZS.
Wyniki III rundy Pucharu Polski:
Terminarz rozgrywek:
Losowanie IV rundy (z udziałem 4 drużyn) – 28 listopada (czwartek)
IV runda – 11 grudnia 2013 r. (środa)
2 drużyny awansują do fazy centralnej.
Faza centralna (z udziałem zespołów Basket Ligi Kobiet i 2 najlepszych drużyn fazy wstępnej):
Losowanie V rundy (9 drużyn, 1 para i 7 wolny los)
– 12 grudnia 2013 r. (czwartek)
V runda – 15 stycznia 2014 r. (środa)Losowanie VI rundy (8 drużyn) – 16 stycznia 2014 r.
VI runda – 29 stycznia 2014 r. (środa)
Losowanie VII rundy (4 drużyny) – 30 stycznia 2014 r.
VII runda – 12 lutego 2014 r. (środa)
2 drużyny awansują do turnieju Final Four.
Turniej Final Four:
7-8 marca 2014 r. (piątek – sobota)
W turnieju finałowym zapewniony udział mają zespoły CCC Polkowice i Wisła Can-Pack Kraków, uczestniczące w rozgrywkach Euroligi.
